265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2553 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  200  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  58.89 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  47.42 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  49 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  47.47 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  49.49 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  46.39 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  45.36 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  41.84 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  38.3 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  35.05 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  34.74 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  33.67 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  32.99 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  35.05 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  36.63 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  32.65 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  31.63 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  32.63 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  31.91 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  35.44 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  29.79 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  31.65 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  28.28 
 
 		 394 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 		 510 aa  54.7  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  28.87 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  27.84 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  30.85 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  27.37 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  28.87 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  31.91 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  32.98 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  37.97 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  32.94 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  30.93 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  34.94 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  28.42 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  34.15 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  29.29 
 
 		 402 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  31.63 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  31.65 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  31.65 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  28.72 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  28.72 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  34.15 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  25.77 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  28.72 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  33.73 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3140  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 129 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>