180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3140 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3140  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 154 aa  310  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5140  Endoribonuclease L-PSP  84.11 
 
 		 155 aa  263  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.7 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  29.29 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  25.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  30.99 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  26.35 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  28.77 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  30.41 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  24.14 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  28.06 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  28.71 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  35.05 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  26.71 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  24.5 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  26.53 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  27.72 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  25.74 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  29 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  25.34 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  27.21 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  27.86 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  25.9 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  25.93 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  28.38 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  22.76 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  25.71 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  26.06 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  27.93 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  30.39 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  25.74 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 123 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  29.6 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  25.71 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  25.36 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  28.06 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  30 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  27.4 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  24.64 
 
 		 126 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  29 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  24.14 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 394 aa  48.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  26.79 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  24.83 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  27.07 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  23.45 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  27.66 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  23.81 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  25.74 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  28.04 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  28.04 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  28.04 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0607666 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  28.04 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  28.04 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  28.04 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  28.04 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  26.95 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  28.85 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  24.16 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  25.35 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  28.28 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2553  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  26.53 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  26.24 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  26.71 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  25.95 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  28.57 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  28.57 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  27.88 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  30.49 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  27.61 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  27.59 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  28.06 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  24.26 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  32.93 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  24.83 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  28.57 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>