More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3465 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  93.1 
 
 		 145 aa  287  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  93.79 
 
 		 145 aa  286  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  88.28 
 
 		 145 aa  273  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  88.28 
 
 		 145 aa  271  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  87.59 
 
 		 145 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  87.59 
 
 		 145 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  86.62 
 
 		 149 aa  266  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  90.58 
 
 		 138 aa  263  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  85.21 
 
 		 144 aa  263  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  90.51 
 
 		 140 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  90.51 
 
 		 140 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  88.15 
 
 		 138 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  85.93 
 
 		 138 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  85.29 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  86.76 
 
 		 139 aa  251  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  84.44 
 
 		 138 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  81.34 
 
 		 136 aa  238  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  85.16 
 
 		 130 aa  236  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  62.41 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 140 aa  183  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  60.29 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  58.52 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  60.15 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 394 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  37.17 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  35.85 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  38.05 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  39.42 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  36.11 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  40.37 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  27.88 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  34.82 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  33.94 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  32.71 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  39.09 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  28.97 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>