287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3991 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  58.54 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  49.18 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 132 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  42.5 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  48.57 
 
 		 205 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  37.1 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  36.29 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  42.62 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  39.62 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  39.62 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  39.62 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  36.7 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  35.77 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  36.79 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>