More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0935 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
135 aa  267  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 
131 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 
132 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  40.98 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  41.98 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  38.32 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  41.73 
 
 
480 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  42.45 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  31.67 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  36.96 
 
 
500 aa  60.1  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  33 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  25.93 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 
130 aa  57  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  31 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  31 
 
 
140 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  35.83 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  27.43 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  34.23 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 
133 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  26.61 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  26.61 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 
140 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  25 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  27.93 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  33.64 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  26.61 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  31.19 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 
124 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  25.2 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  35.71 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>