More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1345 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
126 aa  258  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  88.89 
 
 
127 aa  233  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 
121 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 
121 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 
132 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  49.58 
 
 
128 aa  124  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 
130 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 
132 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 
128 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  38.98 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 
205 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 
131 aa  88.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
204 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  37.4 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  37.4 
 
 
204 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
204 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
204 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  38.33 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
135 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  33.06 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  40.98 
 
 
480 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  33.08 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  36.04 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  37.61 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.62 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 
394 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  32.17 
 
 
402 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  32.46 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>