More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1670 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  263  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  47.2 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  45.16 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 121 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  42.73 
 
 		 113 aa  90.5  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  39.34 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  35.16 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  35.16 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  37.21 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  29.09 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  35.83 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  37.14 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  28.45 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  33.33 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 500 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  29.25 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  29.47 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  33.02 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  27.73 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  30.97 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  31.4 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  27.27 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>