150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2914 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  69.67 
 
 		 135 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  44.63 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  41.13 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  38.52 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  34.4 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  39.83 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  39.83 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  42.97 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  39.53 
 
 		 500 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.55 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  25 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  25.93 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  27.2 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  32.73 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  31.19 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  22.88 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  30.11 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  27.74 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  29.69 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>