254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5724 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  266  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  54.92 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  51.2 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  41.94 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  51.46 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  37.6 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  36.29 
 
 		 129 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  42.5 
 
 		 480 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  33.07 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  33.07 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  36.23 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  35.09 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  30.36 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  35.58 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  35.58 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  35.58 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  29.63 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  26.98 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  27.93 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>