More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2263 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 		 127 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  62.1 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  55.47 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  53.12 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  55.47 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  52.85 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  37.01 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  36.22 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  35.54 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  30.19 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  34.62 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  30.84 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  31.13 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  35.58 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  30.4 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  32.52 
 
 		 480 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  30.33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  25.62 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  30.19 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  34.88 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  25.62 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  32.04 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  30.19 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  34.88 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  32.14 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  36.05 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>