More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0460 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  286  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  74.26 
 
 		 140 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  71.22 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  70.71 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  72.14 
 
 		 140 aa  217  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  63.5 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 129 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  31.15 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  33.87 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  35.48 
 
 		 480 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  41.57 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  33.67 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  31.73 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  27.87 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  36.25 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  29.59 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  32.94 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  31.15 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  29.13 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  32.04 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  35.23 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  36.14 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  33.03 
 
 		 134 aa  50.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  31.96 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  31.96 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.66 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  31.25 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>