274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1591 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  284  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  77.7 
 
 		 140 aa  229  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  74.82 
 
 		 140 aa  223  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  71.22 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  75.94 
 
 		 140 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  63.31 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  35.25 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  33.87 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  37.1 
 
 		 480 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  35.92 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  33.59 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  33.07 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  33.33 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  34.45 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  34.45 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  26.45 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  34.45 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  32.79 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  30.36 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  34.83 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  31.31 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  31.36 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  29.46 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.63 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  28.16 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  31.46 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>