272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1839 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  77.86 
 
 		 140 aa  228  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  74.82 
 
 		 140 aa  223  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  72.14 
 
 		 140 aa  217  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  68.57 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  64.03 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  35.48 
 
 		 480 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  33.59 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  29.84 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  34.4 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  33.61 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  33.61 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  32.8 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  34.82 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  35.63 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  43.94 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  27.05 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  31.97 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  38.2 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  30.71 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  36.25 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  32.04 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  25.93 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  29.07 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  31.07 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  36.49 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  32.53 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  27.05 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  29.13 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  37.14 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>