254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3401 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  89.31 
 
 		 131 aa  237  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  84.73 
 
 		 131 aa  229  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  82.44 
 
 		 131 aa  226  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  83.21 
 
 		 131 aa  222  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  80.15 
 
 		 133 aa  211  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  83.97 
 
 		 131 aa  210  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  54.96 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  31.85 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  26.72 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  26.81 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  33.03 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  28.12 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  30.37 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  28.07 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.81 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.81 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  28.33 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  32.95 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  32.99 
 
 		 394 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  32.95 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.98 
 
 		 402 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  31.82 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  31.82 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  31.82 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  27.59 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  31.82 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  27.42 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  27.86 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  32.69 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  31.82 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  32.95 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>