98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0804 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 392 aa  818    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  41.42 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  29.11 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  28.64 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  26 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  24.54 
 
 		 348 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  24.52 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  28.16 
 
 		 136 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  30.49 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  30.49 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  26.12 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 		 130 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 134 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 129 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 128 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 227 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 343 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2385  Endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 128 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094696  hitchhiker  0.000676577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  32.04 
 
 		 132 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 140 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 126 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  27 
 
 		 129 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  28.16 
 
 		 135 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 140 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  27.13 
 
 		 131 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  27.13 
 
 		 131 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  29 
 
 		 126 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  31 
 
 		 129 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  26.36 
 
 		 131 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 131 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 126 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  26.69 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 128 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 140 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 130 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 131 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  28.18 
 
 		 124 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 132 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  29 
 
 		 129 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 131 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  29.52 
 
 		 128 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 135 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  25.19 
 
 		 158 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 128 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  24.24 
 
 		 136 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 131 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 126 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 129 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  30 
 
 		 128 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  24.24 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  30.84 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 136 aa  45.8  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 129 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  27.03 
 
 		 133 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 131 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  24.24 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  31.63 
 
 		 124 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  25.71 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 123 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 125 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  29.9 
 
 		 124 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 129 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  23.08 
 
 		 139 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 116 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  23.23 
 
 		 145 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  24.77 
 
 		 145 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 129 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  27.61 
 
 		 136 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  27.71 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 138 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  22.22 
 
 		 144 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 127 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  27.83 
 
 		 326 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  29.9 
 
 		 140 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 140 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 131 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  27.83 
 
 		 326 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  29.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  24.77 
 
 		 145 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  26.67 
 
 		 135 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  26.13 
 
 		 159 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  24.77 
 
 		 145 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>