48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2220 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 389 aa  806    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  29.11 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  27.09 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  31.28 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  30.21 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  29.73 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  29.79 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  29.79 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  26.98 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  28.63 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  29.13 
 
 		 130 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  26.67 
 
 		 127 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  30.24 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 128 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  25.71 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  27.19 
 
 		 134 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  27.63 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  33.8 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 146 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  25.74 
 
 		 139 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 130 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 132 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 130 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  27.18 
 
 		 130 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  26.34 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  27.36 
 
 		 135 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  29 
 
 		 130 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 133 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  28.57 
 
 		 134 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  36.67 
 
 		 117 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 133 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  26.42 
 
 		 127 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  24.76 
 
 		 127 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  27.45 
 
 		 128 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  23.81 
 
 		 127 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  27.36 
 
 		 126 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  25.18 
 
 		 133 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  24.76 
 
 		 129 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 116 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  29.93 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 149 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>