27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0932 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 357 aa  729    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  100 
 
 		 357 aa  729    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  53.02 
 
 		 353 aa  272  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  51.44 
 
 		 334 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  42.23 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 430 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  45.48 
 
 		 409 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  43.04 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  45.07 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  43.49 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 		 343 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  36.97 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  39.5 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  37.69 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  40.26 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  35.25 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  33.33 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  33.33 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  36.36 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  27.96 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  29.79 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  25.74 
 
 		 362 aa  52.8  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  30.49 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 144 aa  42.7  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>