32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2681 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 343 aa  697    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  56.29 
 
 		 344 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  45.05 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  45.85 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  47.93 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  45.21 
 
 		 430 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  52.77 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  52.77 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  43.71 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  44.07 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  40.64 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  35.74 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  35.87 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  42.13 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  41.81 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  38.75 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  33.08 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  29.64 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  30.67 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  30.86 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 124 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 131 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  35.44 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 		 131 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  27.41 
 
 		 131 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  26.91 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  24.81 
 
 		 132 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>