25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2809 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 430 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  94.68 
 
 		 432 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  80.49 
 
 		 409 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  75.12 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  82.53 
 
 		 330 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  50.61 
 
 		 353 aa  256  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  46.6 
 
 		 334 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  45.21 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  44.95 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  45.36 
 
 		 344 aa  226  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  38.61 
 
 		 335 aa  210  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  37.75 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  37.09 
 
 		 326 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  43.1 
 
 		 314 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  37.42 
 
 		 348 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  39.52 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  36.3 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  38.13 
 
 		 335 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  33.77 
 
 		 383 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  28.16 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  30.73 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>