26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2127 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  43.87 
 
 		 324 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  45.49 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  38.99 
 
 		 335 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  36.97 
 
 		 357 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 357 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  36.17 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  36.17 
 
 		 326 aa  190  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  42.86 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  38.89 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  43.37 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  40.07 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  37.46 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  42.13 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 430 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  37.42 
 
 		 430 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  38.13 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  33.8 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  30.05 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  24.54 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  26.86 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  26.34 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>