25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1054 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  672    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  44.48 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  45.49 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  41.64 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  45.26 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  40.13 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  37.69 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  37.54 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  38.41 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  45.93 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 430 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  42.32 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  42.32 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  37.89 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  44.02 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  32.23 
 
 		 383 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  29.15 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  29.33 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  29.93 
 
 		 389 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>