26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4196 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 334 aa  685    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  48.45 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  51.44 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  51.44 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  47.81 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  46.75 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  46.42 
 
 		 430 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  47.75 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  44.77 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  39.42 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  39.05 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  38.93 
 
 		 335 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  37.46 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  38.27 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  41.2 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  39.83 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  34.56 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  30.66 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  29.22 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  27.06 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  26.98 
 
 		 389 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>