27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2762 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  702    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  53.02 
 
 		 357 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  53.02 
 
 		 357 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  48.45 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  50.15 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  50.92 
 
 		 430 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  50.92 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  48.86 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 432 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  50.35 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  45.93 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 343 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  41.37 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  40.07 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  35 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  38.41 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  38.35 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  38.62 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  34.41 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  37.98 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  39.27 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  28.63 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  29.65 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  29.39 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  26.14 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  26.98 
 
 		 130 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>