35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1932 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 362 aa  747    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  28.02 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  30.97 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  29.22 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  27.36 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  30.67 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  27.63 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  26 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  27.63 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  29.22 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  29.67 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  26.86 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  26.64 
 
 		 432 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  25.74 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  25.74 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  29.33 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 131 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  26.69 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  25.45 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  30.14 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 142 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  26.23 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  29.25 
 
 		 140 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 131 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  34.72 
 
 		 125 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 136 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  36.49 
 
 		 132 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  37.18 
 
 		 125 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  26.55 
 
 		 126 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  28.71 
 
 		 130 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>