27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6087 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 409 aa  812    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  84.06 
 
 		 430 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  81.68 
 
 		 430 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  81.49 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  85.76 
 
 		 330 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  47.81 
 
 		 334 aa  250  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  48.86 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  45.85 
 
 		 343 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  45.48 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  45.48 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  43.58 
 
 		 344 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  40.26 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  38.92 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  43.55 
 
 		 314 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  40.94 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  35.79 
 
 		 326 aa  156  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  39.05 
 
 		 348 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  38.06 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  40.16 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  35.91 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  33.92 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  30.21 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  29.67 
 
 		 362 aa  57  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  36.67 
 
 		 128 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>