More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03190 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03190  lipoprotein  100 
 
 		 158 aa  327  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6227  hypothetical protein  48.41 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.138993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4111  Endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 127 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 131 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 131 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  36.94 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  38.74 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.67 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  39.64 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  43.81 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  40.91 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  42.4 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  43.01 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  36.11 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  41.38 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  38.14 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3438  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.259362  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  41.18 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  36.75 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  37.61 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  40.91 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  39.82 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.19 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  41.76 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  32.76 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  42.16 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  39.8 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>