295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0682 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 161 aa  323  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  89.51 
 
 		 162 aa  287  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  79.59 
 
 		 147 aa  247  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  50.77 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  47.86 
 
 		 185 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  50.77 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 		 136 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  40.85 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 137 aa  104  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 133 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  37.29 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  32.84 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.08 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.08 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  35.51 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  30.41 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  37.68 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  38.93 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  34.82 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.09 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  26.87 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  31.94 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  35.11 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  31.65 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  33.57 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  32.11 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  26.89 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 126 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  32.11 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 132 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>