More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1441 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  53.49 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3074  Endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2969  Endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2881  endoribonuclease L-PSP  43.38 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  30.95 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  30.95 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  41.04 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  41.04 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  41.04 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  36.03 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  33.66 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  41.9 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.14 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  27.13 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  34.65 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  34.65 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  28.43 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  28.43 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  34.62 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  29.9 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  34.04 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  32.08 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  33.02 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  33.02 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>