165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0382 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  53.49 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2969  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3074  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2881  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 128 aa  66.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  32.82 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  32.82 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  33.07 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  27.07 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 136 aa  57  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  33.08 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  28.36 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  27.21 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  30.58 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  27.62 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  29.29 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  25.24 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  30.39 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 377 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  28.21 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  27.61 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  28.15 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  28.71 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  25.76 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  29.7 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  26.73 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  26.79 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  27.88 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  34.65 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  34.65 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  32.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>