262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4718 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 158 aa  319  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  49.63 
 
 		 185 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  45.8 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  45.8 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  46.56 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  40.44 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  33.76 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  34.03 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  28.15 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.17 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  29.32 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  27.13 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  27.01 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  35.05 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  33.33 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  29.55 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  30.53 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  27.03 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  24.79 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  30.58 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  26.98 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>