More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0780 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  269  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  89.15 
 
 		 132 aa  247  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  81.4 
 
 		 129 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  81.4 
 
 		 129 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  81.4 
 
 		 131 aa  226  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  82.17 
 
 		 132 aa  224  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  80.62 
 
 		 130 aa  223  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  79.84 
 
 		 131 aa  223  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  79.84 
 
 		 131 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  79.84 
 
 		 131 aa  223  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  79.07 
 
 		 131 aa  220  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  79.07 
 
 		 131 aa  220  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  79.07 
 
 		 131 aa  220  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  79.07 
 
 		 131 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  79.07 
 
 		 130 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  78.29 
 
 		 131 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  78.29 
 
 		 131 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  75.97 
 
 		 135 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  74.42 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  71.32 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  62.79 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  62.02 
 
 		 135 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  60.47 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  80.65 
 
 		 108 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  61.24 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  58.91 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  60.16 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  58.91 
 
 		 132 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  58.27 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0849  Endoribonuclease L-PSP  58.91 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499919  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  43.41 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  37.5 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  36.84 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  36.84 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1661  endoribonuclease L-PSP  86.84 
 
 		 38 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  41.24 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  38.05 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.67 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  44.9 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  37.11 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  39.18 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  40.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  43.53 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  36.94 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1494  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  38.05 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  33.64 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  36.19 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  38.78 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>