More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1711 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  79.84 
 
 		 129 aa  220  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  79.84 
 
 		 129 aa  220  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  77.52 
 
 		 131 aa  216  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  77.52 
 
 		 131 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  77.52 
 
 		 131 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  77.52 
 
 		 131 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  77.52 
 
 		 131 aa  216  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  77.52 
 
 		 131 aa  216  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  77.52 
 
 		 131 aa  216  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  77.52 
 
 		 131 aa  216  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  76.74 
 
 		 131 aa  214  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  76.74 
 
 		 131 aa  214  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  74.81 
 
 		 132 aa  214  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  75.97 
 
 		 129 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  73.64 
 
 		 130 aa  205  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  74.42 
 
 		 132 aa  204  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  73.64 
 
 		 140 aa  203  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  69.77 
 
 		 130 aa  200  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  71.32 
 
 		 132 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  60.94 
 
 		 131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  79.57 
 
 		 108 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  58.91 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  59.69 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  61.24 
 
 		 134 aa  155  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  59.09 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  59.38 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  58.14 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 		 135 aa  150  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  57.36 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  57.48 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0849  Endoribonuclease L-PSP  54.26 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499919  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  38.64 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  37.72 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  37.72 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  36.84 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1661  endoribonuclease L-PSP  86.84 
 
 		 38 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  35.14 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  39.47 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5083  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  34.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  39.39 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  36.94 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  29.09 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1494  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  36.11 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.04 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  33 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>