133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4473 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  61.76 
 
 		 140 aa  167  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  54.74 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07059  conserved hypothetical protein  36.69 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219102  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04125  conserved hypothetical protein  36.5 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386288 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09338  L-PSP endoribonuclease family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03420)  35.66 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.920057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  32.85 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09123  hypothetical protein  34.93 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  34.88 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  34.11 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  34.11 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  34.11 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  34.11 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  34.11 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  34.11 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  31.78 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  31.78 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  28.26 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  30.58 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  30.77 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  30.71 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  30.71 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  29.46 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  30.07 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  27.87 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  29.32 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  32.86 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  32.86 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  29.41 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  33.33 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  28.43 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  31.07 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  28.43 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  30.71 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  29.79 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  28.97 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  26.83 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  32.98 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  31.07 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>