278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5535 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
131 aa  271  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  56.49 
 
 
131 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  54.96 
 
 
131 aa  154  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  54.2 
 
 
131 aa  153  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  54.2 
 
 
131 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  53.49 
 
 
133 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  51.15 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  51.15 
 
 
131 aa  140  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  50.38 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 
142 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 
130 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  29.69 
 
 
154 aa  60.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 
146 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  35.88 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  31.39 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  33.33 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  28.03 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  25.95 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  37.62 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  37.62 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  36.63 
 
 
207 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.81 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.81 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 
175 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 
132 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 
510 aa  53.9  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 
136 aa  53.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  31.3 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 
133 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  27.56 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 
394 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 
362 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  35 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  35.24 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  26.19 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  30.69 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  30.69 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  30.69 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  31.06 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>