52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6626 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6626  Putative translation initiation inhibitor yjgF family-like protein  100 
 
 		 345 aa  661    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.708369  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4068  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611141  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 133 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  35.16 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  34.75 
 
 		 132 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 136 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 128 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 130 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 130 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  46.97 
 
 		 129 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  36.44 
 
 		 131 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 124 aa  49.7  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 147 aa  49.7  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 137 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 141 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 135 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 140 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 137 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  31.93 
 
 		 124 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.88 
 
 		 127 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 126 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 133 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 132 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 124 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 140 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 135 aa  46.2  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  32.31 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 132 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  32.03 
 
 		 129 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 124 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  32.31 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 129 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  37.66 
 
 		 130 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 130 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 129 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 126 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  30.28 
 
 		 158 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  29.07 
 
 		 128 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 126 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  31.4 
 
 		 127 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  29.07 
 
 		 128 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 128 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 		 128 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 126 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 146 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 127 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>