94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4068 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4068  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 405 aa  816    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6626  Putative translation initiation inhibitor yjgF family-like protein  39.83 
 
 		 345 aa  212  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.708369  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 149 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 130 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 128 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  39.76 
 
 		 129 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 128 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 132 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 140 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 129 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 131 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 136 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 145 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 141 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 136 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 137 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 137 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 137 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 138 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 137 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  28.28 
 
 		 131 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 139 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 129 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 139 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 135 aa  49.7  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 145 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 127 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 131 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  32.74 
 
 		 136 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 126 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 138 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 143 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  32.46 
 
 		 140 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  25.76 
 
 		 140 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  32.46 
 
 		 140 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 127 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 137 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 149 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 138 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 132 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  35.19 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 127 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 132 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 127 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 140 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 140 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 136 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 130 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 140 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 130 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  31.18 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  26.12 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  26.12 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 145 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  35.56 
 
 		 128 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  26.12 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 130 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  26.12 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 145 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  29.52 
 
 		 133 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 132 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 137 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 126 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  27.59 
 
 		 134 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 135 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 133 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 126 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 131 aa  43.5  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  34.83 
 
 		 129 aa  43.1  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 137 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 145 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 137 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 127 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  29.66 
 
 		 131 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  32.22 
 
 		 128 aa  43.1  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 128 aa  42.7  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 135 aa  42.7  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 		 134 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3111  Endoribonuclease L-PSP  32.97 
 
 		 130 aa  42.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  27.19 
 
 		 145 aa  43.1  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  27.19 
 
 		 145 aa  43.1  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 132 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>