More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3111 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3111  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  270  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  81.4 
 
 		 130 aa  206  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  77.52 
 
 		 132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  72.87 
 
 		 129 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  57.81 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0660  endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  57.81 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  57.81 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2390  putative endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  57.03 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  57.03 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  57.03 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  56.25 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  56.25 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  56.25 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  59.32 
 
 		 123 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  52.71 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  57.26 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2507  endoribonuclease L-PSP  53.44 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.022272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2779  endoribonuclease L-PSP family protein  54.2 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  56.35 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  56.35 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  57.14 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0969  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06352  ribonuclease  68.48 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  37.8 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  38.58 
 
 		 130 aa  83.6  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  36.21 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  37.96 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  34.86 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  37.04 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  36.79 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.24 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.24 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  35.24 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  36.79 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  40.19 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  37.14 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  36.45 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  32.08 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>