25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1904 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1904  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 107 aa  217  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.342175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  27.72 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  29.21 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  34.18 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2407  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 140 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3975  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.123478 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  28.4 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 129 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>