171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4825 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  43.85 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6288  Endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 377 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  35.59 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  33.08 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.07 
 
 		 402 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  27.87 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  28.1 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  30.65 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  26.45 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  34.75 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  30.63 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.59 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.59 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  28.03 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  27.69 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 		 510 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  25.58 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  31.25 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  28.21 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  28.21 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  30.7 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  27.5 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  26.89 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  33.9 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  28.21 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 394 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  32.22 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  31.11 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  28.57 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>