166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6288 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6288  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  266  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 377 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  33.07 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  33.07 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  33.07 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  31.34 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  27.87 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  31.13 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  28.47 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  34.26 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  35.61 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  25.86 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  33.91 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  30.85 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  30.37 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 394 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  29.92 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  27.43 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  30.19 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  30.19 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  31.5 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  26.85 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  32.53 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  32.61 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  27.56 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  27.88 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  32.31 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  30.43 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  26.4 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  29.36 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  31.33 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  24.53 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  31.52 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  28.03 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  29.09 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  26.09 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  25.98 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  31.93 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  31.46 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  27.01 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>