219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0820 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0820  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 152 aa  296  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  40.37 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  36.15 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  46.48 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0887  endoribonuclease L-PSP  32.29 
 
 		 421 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.236769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  35.59 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  33.61 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  31.97 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  28.79 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  34.75 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  40 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  34.19 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  27.82 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5133  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81404  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  31.62 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  41.33 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0087  Endoribonuclease L-PSP  32.61 
 
 		 422 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.381775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  31.97 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  29.2 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  39.08 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  25.64 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  39.29 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  34.88 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  31.15 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  31.97 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  31.97 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  55.88 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  31.62 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>