More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5133 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5133  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  266  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81404  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2015  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1144  putative endoribonuclease, translationalinhibitor protein  40 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  33.59 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  32 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  32.54 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0291  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  30.4 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  31.2 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  33.88 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  32.5 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  33.88 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  32.79 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  31.97 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  34.43 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  31.4 
 
 		 127 aa  66.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  38.89 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  33.06 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  32.23 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  31.2 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  32.23 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  32 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  31.45 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  33.59 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  34.15 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  29.6 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  31.97 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  33.9 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  31.15 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>