More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1144 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1144  putative endoribonuclease, translationalinhibitor protein  100 
 
 		 137 aa  279  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2015  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5133  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81404  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  39.66 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  39.2 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  41.9 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  34.71 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  38.58 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  35 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  37.29 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  35 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  39.81 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  33.06 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40.95 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  37.07 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  33.06 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  41.9 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  30.58 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  34.71 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  37.74 
 
 		 120 aa  67  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  35.34 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 126 aa  67  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  33.86 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  34.71 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  32.5 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  35.85 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  35.24 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  32.26 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  36.67 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  35.24 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  39.05 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>