242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1661 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 152 aa  317  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3975  hypothetical protein  57.66 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.123478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1859  endoribonuclease L-PSP  56.93 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  53.15 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  30.4 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  28.23 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  27.46 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  40.45 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  29.75 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  31.93 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  25.85 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  24.06 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.78 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  32.52 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  33.88 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  27.41 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  32.5 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  27.83 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  31.72 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  32.31 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  32.31 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  27.52 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  27.55 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>