27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1993 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1993  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0722461  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  39.44 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  41.43 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  40 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  38.57 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  38.57 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  38.57 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  38.57 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  38.03 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  40.58 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  40.58 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  31.71 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  31.71 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  23.36 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 158 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  30.68 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>