60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1381 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1381  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02286  TdcF  52.05 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  48.45 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0861  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2630  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1722  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3006  deaminase AmnE, putative  40.77 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0930395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2887  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0067  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  50.8  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3200  Endoribonuclease L-PSP  27.83 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  41.11 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  41.11 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  29.08 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0084  Endoribonuclease L-PSP  29.94 
 
 		 237 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  32.61 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  36.26 
 
 		 126 aa  48.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 129 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  37.36 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  28.29 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  33.67 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  31.62 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  32.97 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  30.77 
 
 		 130 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 126 aa  44.3  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  31.87 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00870  conserved hypothetical protein  37.23 
 
 		 117 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  30.77 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  33.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.51 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  34.41 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  31.9 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5320  endoribonuclease L-PSP  30.49 
 
 		 156 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  31.87 
 
 		 126 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  28.36 
 
 		 132 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  32.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 124 aa  41.2  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  32 
 
 		 127 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 131 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3962  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.362105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 123 aa  40.8  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 131 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>