More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00870 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00870  conserved hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  242  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05543  conserved hypothetical protein  78.45 
 
 
116 aa  185  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00417215  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  50.48 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  44 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  44 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  47.12 
 
 
125 aa  94.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  49.41 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  48.24 
 
 
124 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  48.24 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  48.24 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  48.24 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  41.6 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  45.98 
 
 
127 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  45.98 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  45.98 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  45.98 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  45.98 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  45.98 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  45.98 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  42.06 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  37.5 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  45.98 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  37.5 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  39.83 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  35.43 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3962  Endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.362105  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6464  Endoribonuclease L-PSP  46.24 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.988681  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  41.51 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  45.92 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  36.72 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  38.28 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 
125 aa  76.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  41.9 
 
 
129 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  41.75 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3967  Endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2445  Endoribonuclease L-PSP  44.33 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572678  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  35 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  38.21 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  37.3 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  37.5 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00590  mitochondrial genome maintenance-related protein, putative  34.82 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0239835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01480  Brt1, putative  43.02 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.683289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  43.53 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>