70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0702 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  51.23 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02286  TdcF  51.75 
 
 		 155 aa  147  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0861  endoribonuclease L-PSP  48.47 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1722  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2630  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1381  endoribonuclease L-PSP  46.04 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3006  deaminase AmnE, putative  38.85 
 
 		 144 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0930395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2887  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 144 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0084  Endoribonuclease L-PSP  32.72 
 
 		 237 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3200  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1464  endoribonuclease L-PSP  39.78 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.643404  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0067  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 244 aa  52.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 127 aa  50.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 129 aa  47.8  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  33.64 
 
 		 129 aa  47.4  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 131 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  32.97 
 
 		 116 aa  47.4  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  27.12 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  25.76 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  25.17 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  33.03 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  37.65 
 
 		 126 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  30.23 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  32.73 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  25.42 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 126 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  23.73 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  32.77 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  27.01 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  30.66 
 
 		 125 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  25.42 
 
 		 143 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1123  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  27.54 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  34.12 
 
 		 125 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  32.11 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  32.11 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 132 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 128 aa  40.8  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>