58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1722 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1722  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 170 aa  348  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02286  TdcF  51.72 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  46.11 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0861  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  45.14 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2887  endoribonuclease L-PSP  43.18 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3006  deaminase AmnE, putative  42.75 
 
 		 144 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0930395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1381  endoribonuclease L-PSP  43.17 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2630  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0084  Endoribonuclease L-PSP  28.33 
 
 		 237 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3200  Endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  29.41 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  34.44 
 
 		 124 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 125 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0067  Endoribonuclease L-PSP  27.83 
 
 		 244 aa  47.8  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  28.99 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  34.44 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  34.44 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  34.44 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  34.44 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  34.44 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  34.44 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  34.44 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  30.66 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  29.01 
 
 		 125 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  31.78 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  28.47 
 
 		 130 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 135 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  27.96 
 
 		 145 aa  44.3  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  28.03 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  28.72 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  27.96 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  26.88 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 126 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  28.82 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 129 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  34.19 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  28.07 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 125 aa  41.6  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  29.91 
 
 		 129 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>