14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3200 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3200  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0084  Endoribonuclease L-PSP  56.52 
 
 		 237 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0067  Endoribonuclease L-PSP  53.2 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2887  endoribonuclease L-PSP  30.06 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0861  endoribonuclease L-PSP  27.06 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3006  deaminase AmnE, putative  29.81 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0930395  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02286  TdcF  28.22 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1381  endoribonuclease L-PSP  26.62 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2630  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  45.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 126 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 126 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>